Признак |
Подтипы рака
* |
|||
Люминал. A |
Люминал. B |
HER2 |
Базалоид. |
|
Содержание клеток ER+/HER2– |
87 % |
82 % |
20 % |
10 % |
Содержание клеток HER2+ |
7 % |
15 % |
68 % |
2 % |
Содержание клеток TNBC |
2 % |
1 % |
9 % |
80 % |
Путь p53 |
Мутация TP53 (12 %) Увеличение MDM2 (14 %) |
Мутация TP53 (32 %) Увеличение MDM2 (31 %) |
Мутация TP53 (75 %) Увеличение MDM2 (30 %) |
Мутация TP53 (84 %) Увеличение MDM2 (14 %) |
Путь PIK3CA/PTEN |
Мутация PIK3CA (49 %) Мутация/потеря PTEN (13 %) Потеря INPP4B (9 %) |
Мутация PIK3CA (32 %) Мутация/потеря PTEN (24 %) Потеря INPP4B (16 %) |
Мутация PIK3CA (42 %) Мутация/потеря PTEN (19 %) Потеря INPP4B (30 %) |
Мутация PIK3CA (7 %) Мутация/потеря PTEN (35 %) Потеря INPP4B (30 %) |
Путь RB1 |
Высокая экспрессия RB1 Усиление Cyclin D1 (29 %) Увеличение CDK4 (14 %) Низкая экспрессия CDKN2C |
Усиление Cyclin D1 (58 %) Увеличение CDK4 (25 %) |
Усиление Cyclin D1 (38 %) Увеличение CDK4 (24 %) |
Мутация/потеря RB1 (20 %) Усиление Cyclin E1 (9 %) Высокая экспрессия CDKN2A |
Экспрессия mRNA |
Высокий ER-кластер Низкая пролиферация |
Низкий ER-кластер Высокая пролиферация |
HER2-сигнатура Высокая пролиферация |
Базальная сигнатура Высокая пролиферация |
Число копий |
Увеличение диплоидов Многие со спокойными геномами |
Увеличение анеплоидов Многие с фокальным усилением |
Увеличение анеплоидов Высокая геномная нестабильность |
Увеличение анеплоидов Высокая геномная нестабильность |
Мутации ДНК |
PIK3CA (49 %) TP53 (12 %) GATA3 (14 %) MAP3K1 (14 %) |
TP53 (32 %) PIK3CA (32 %) MAP3K1 (5 %) |
TP53 (75 %) PIK3CA (42 %) PIK3R1 (8 %) |
TP53 (84 %) PIK3CA (7 %) |
Метилирование ДНК |
Гипер-метилирование |
Гипо-метилирование |
||
Экспрессия белка |
Высокая сигнализация эстрогена Высокий cMYB Субтип, реагирующий на RPPA |
Меньшая сигнализация эстрогена Высокий FOXM1 и cMYC Субтип, реагирующий на RPPA |
Высокая экспрессия HER1 и HER2 |
Высокая экспрессия белков репарации ДНК, PTEN и потеря сигнатуры p-AKT |